Sekolah Tinggi Teologi Kalvari Manado didirikan dibuka pada hari Sabtu, tanggal 1 September 2001 dalam sebuah ibadah pembukaan yang dipimpin langsung oleh BPP GKPMI Periode 1997-2001: Pdt. Wilson Takuling sebagai Sekertaris Umum, Pdt. Yahya Bawatji (Bendahara Umum), Pdt. Yosafat Padoma (Penasehat BPP) dan dihadiri oleh hamba-hamba Tuhan Bersama jemaat dan sejumlah mahaiswa. Ibadah dilaksanakan di sebuah rumah di Jl. Mogandi 14 atau yang dikenal dengan Perumahan PDK Sebelas, Kelurahan Malalayang Satu, Kec. Malalayang, Kota Manado.

Dukungan langsung diberikan oleh gereja di Kota Manado GKPMI Betlehem Manado, GKPMI Betania Manado Bersama Gembala Sidang dan jemaatnya sehingga STT Kalvari Manado dapat dibuka dan diresmikan.